1、生产过程
在农业部注册的生物有机肥料生产企业基本从事微生物肥料的生产。在发酵生产过程中，大多采用槽堆发酵法和其他发酵方法。
2、生产技术
在发酵材料的后处理中，大多数公司会添加功能性细菌以进行复合和成型。产品配方主要是粉尘，但有些使用鼓式造粒或挤出造粒。粒状产品克服了粉状产品外观差和含量低的缺点，提高了产品的商业性，还增加了企业的生产成本，对有效细菌的生存有一定影响。
3、细菌的种类和用途
微生物菌株是生物有机肥料产品的核心。在生产过程中，通常有两个涉及微生物使用的环节：
一种是添加分解真菌剂，其在分解过程中促进材料的分解，分解并具有除臭功能。它主要由复合细菌组成。常见的细菌种类包括光合细菌，乳酸菌，酵母菌，放线菌，青霉菌，木霉菌等。
二是在物料分解后添加的功能细菌，通常是氮细菌，磷酸盐增溶细菌，硅酸盐细菌，乳酸菌，假单胞菌，放线菌等，它们在产品中起特定的肥料作用。
因此，对于生产生物有机肥料，微生物菌株的筛选和使用是一项核心技术。只有掌握了这一关键技术，才能加速材料的分解和成熟，才能保证产品的应用效果。

4、销售与应用
由于生物有机肥料的生产成本高于普通有机肥料，因此主要用于蔬菜，水果，中草药等高附加值的经济作物，取得了较好的效果。
生物有机肥料在提高农产品质量方面起着不可替代的作用，但是在生产和销售方面仍然存在一定的困难。这是因为高质量和高价格还没有完全达到优质农产品的质量，这在一定程度上影响了农民的成长。生物有机肥料的积累阻碍了生物有机肥料的推广。
近年来，生物有机肥料已在一些生态示范区和绿色有机农产品基地广泛使用。这是未来生物有机肥料发展的主要方向。随着绿色有机农产品生产规模的扩大和人们消费水平的提高，生物有机肥料的生产和应用必将成为主流。